Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms