Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I0

Trav6d-4, T cell receptor alpha variable 6D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6d-4Q5R1I0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6d-4Q5R1I0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6d-4Q5R1I0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms