Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp3Q5QGU6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms