Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms