Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rtl6Q505G4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl6Q505G4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rtl6Q505G4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rtl6Q505G4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl6Q505G4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl6Q505G4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl6Q505G4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl6Q505G4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl6Q505G4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl6Q505G4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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