Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap1-4Q3V2D6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms