Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BB287469Q3UT53 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms