Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pitpnm3Q3UHE1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms