Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc177Q3UHB8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms