Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil3Q3UFQ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms