Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms