Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnft2Q3UF64 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms