Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yipf3Q3UDR8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms