Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trafd1Q3UDK1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms