Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hectd3Q3U487 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms