Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt2Q3TTY5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt2Q3TTY5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms