Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms