Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms