Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc2Q3SXD3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms