Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd11Q1RNF8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms