Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttc39dQ0VF76 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Ttc39dQ0VF76 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ttc39dQ0VF76 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ttc39dQ0VF76 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ttc39dQ0VF76 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Ttc39dQ0VF76 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ttc39dQ0VF76 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ttc39dQ0VF76 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms