Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps8Q0P5W1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms