Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Plac8l1Q08EJ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Plac8l1Q08EJ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms