Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms