Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnma1Q08460 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms