Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms