Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox13Q04891 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms