Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs2Q03350 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms