Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms