Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Muc1Q02496 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms