Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms