Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf1P84078 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf1P84078 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf1P84078 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf1P84078 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf1P84078 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms