Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms