Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx2P81066 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx2P81066 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx2P81066 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms