Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ErfP70459 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ErfP70459 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ErfP70459 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ErfP70459 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ErfP70459 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ErfP70459 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ErfP70459 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ErfP70459 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ErfP70459 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms