Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx4P70452 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx4P70452 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms