Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhobP62746 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhobP62746 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RhobP62746 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhobP62746 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhobP62746 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhobP62746 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhobP62746 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms