Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd1P62315 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms