Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms