Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms