Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CirbpP60824 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms