Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhbdl3P58873 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms