Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Setd4P58467 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms