Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms