Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms