Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aqp4P55088 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms