Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms