Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms