Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ApodP51910 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ApodP51910 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ApodP51910 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ApodP51910 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ApodP51910 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ApodP51910 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms