Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms