Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FanccP50652 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FanccP50652 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanccP50652 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanccP50652 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanccP50652 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanccP50652 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanccP50652 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanccP50652 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanccP50652 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanccP50652 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanccP50652 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanccP50652 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanccP50652 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanccP50652 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FanccP50652 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FanccP50652 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FanccP50652 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanccP50652 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FanccP50652 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanccP50652 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FanccP50652 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanccP50652 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanccP50652 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanccP50652 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanccP50652 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanccP50652 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanccP50652 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanccP50652 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms